Suzume è nata in un piccolissimo paesino di campagna dove, quasi isolata dal resto del mondo, ha vissuto per tutti i suoi 15 anni. Un giorno, dopo che al padre tocca trasferirsi all’estero per lavoro, la ragazza si ritrova affidata alle cure del giovane zio materno e iscritta in un liceo della modernissima e tentacolare Tokyo. Neanche il tempo di arrivare in città, che Suzume viene avvicinata da un tipo strano, che cerca di evitare. L’indomani, nella nuova scuola, la giovane incontra di nuovo quel ragazzo: è il professor Shishio, l’insegnante responsabile della sua classe. Tra sorprese e nuove amicizie, inizia l’avventura di Suzume per adattarsi a vivere nella rutilante e frenetica capitale.